Automatic Extraction of Protein-Protein Interactions from Medical Papers

dc.contributorAalto-yliopistofi
dc.contributorAalto Universityen
dc.contributor.advisorArppe, Antti
dc.contributor.authorVesalainen, Heikki
dc.contributor.departmentTietotekniikan osastofi
dc.contributor.schoolTeknillinen korkeakoulufi
dc.contributor.schoolHelsinki University of Technologyen
dc.contributor.supervisorSimula, Olli
dc.date.accessioned2020-12-04T19:23:00Z
dc.date.available2020-12-04T19:23:00Z
dc.date.issued2005
dc.description.abstractTämä diplomityö esittelee tiedoneristämisjärjestelmän, jonka tarkoituksena on eristää etenkin proteinien välisistä vuorovaikutuksista kertovaa tietoa biolääketieteellisistä teksteistä. Järjestelmä käyttää tekstin analysointiin kaupallisesti saatavilla olevaa, yleiskäyttöistä luonnollisen kielen jäsennintä, sekä kahden tyyppisiä sääntöjä: linkkisääntöjä ja säännöllisiä lausekkeita. Edellisistä linkkisäännöt tarkastelevat jäsentimen tuottamia, sanojen suhteista (kuten adjektiivi, subjekti tai objekti) kertovia syntaktisia riippuvuuksia. Järjestelmää testataan joukolla annotoituja lauseita ja järjestelmän hahmontunnistusmodulin tehokkuutta mitataan. Kokeen järjestely, tulokset ja analyysi kuvataan luvussa 6. Numeeriset tulokset ovat seuraavat: saanti 51%, tarkkuus 100% ja f-score 68%.fi
dc.format.extent(8) + 64
dc.identifier.urihttps://aaltodoc.aalto.fi/handle/123456789/92630
dc.identifier.urnURN:NBN:fi:aalto-2020120451465
dc.language.isoenen
dc.programme.majorInformaatiotekniikkafi
dc.programme.mcodeT-115fi
dc.rights.accesslevelclosedAccess
dc.subject.keywordinformation extractionen
dc.subject.keywordtiedon eristäminenfi
dc.subject.keywordIEen
dc.subject.keywordluonnollisen kielen käsittelyfi
dc.subject.keywordnatural language processingen
dc.subject.keywordbioinformatiikkafi
dc.subject.keywordNLPen
dc.subject.keywordbioinformaticsen
dc.titleAutomatic Extraction of Protein-Protein Interactions from Medical Papersen
dc.titleProteinien välisten vuorovaikutusten automaattinen eristäminen lääketieteellisistä julkaisuistafi
dc.type.okmG2 Pro gradu, diplomityö
dc.type.ontasotMaster's thesisen
dc.type.ontasotPro gradu -tutkielmafi
dc.type.publicationmasterThesis
local.aalto.digiauthask
local.aalto.digifolderAalto_10432
local.aalto.idinssi28844
local.aalto.openaccessno

Files