Pitkien yksijuosteisten DNA-molekyylien suunnittelu ja valmistus DNA-origamirakenteiden käyttöön

No Thumbnail Available

Files

URL

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Kemiantekniikan korkeakoulu | Bachelor's thesis
Electronic archive copy is available locally at the Harald Herlin Learning Centre. The staff of Aalto University has access to the electronic bachelor's theses by logging into Aaltodoc with their personal Aalto user ID. Read more about the availability of the bachelor's theses.

Date

2024-05-30

Department

Major/Subject

Biotuotteet

Mcode

CHEM3048

Degree programme

Kemiantekniikan kandidaattiohjelma

Language

fi

Pages

31

Series

Abstract

DNA on nykyään yksi laajimmin käytetyistä molekyylirakenteista itsekokoavien materiaalien suunnittelussa. Näitä nanomittakaavan DNA:lla valmistettuja materiaaleja käytetään yhä enemmän erilaisissa sovelluksissa kuten syövän immuunihoidossa ja lääkkeiden annostelujärjestelmissä. DNA-origamitekniikka on menetelmä, jossa kootaan näitä kaksi- ja kolmiulotteisia DNA-origamirakenteita taittamalla pitkä yksijuosteinen DNA-molekyyli lyhyillä komplementaarisilla oligonukleotideillä haluttuun muotoon. Yleisin käytetty runkojuoste DNA-origamirakenteiden valmistuksessa on virusperäinen pyöreä yksijuosteinen M13mp18-genomi, jolla on rajalliset mahdollisuudet lopullisten sekvenssin ja rakenteiden koon kannalta. Valmiiden rakenteiden koot ovat riippuvaisia runkojuosteen pituudesta ja siksi rakenteiden valmistuksessa räätälöityjen runkojuosteiden suunnittelu- ja valmistusmenetelmistä on tullut ratkaisevia. Tämä kandidaatintyö perehtyy erilaisiin niin perinteiseen kuin räätälöityjen runkojuosteiden suunnittelu- ja valmistusmenetelmiin, joita ovat bakteriofagipohjaiset menetelmät, PCR-pohjaiset menetelmät sekä entsymaattiset menetelmät. Yleisin tapa valmistaa runkojuosteita on yhä perinteinen bakteriofagipohjainen menetelmä sen yksinkertaisuuden sekä hyvän tuotantosaantonsa vuoksi. Muilla menetelmillä voidaan vaikuttaa runkojuosteiden sekvensseihin ja pituuksiin ja siten valmistaa räätälöityjä runkojuosteita. Näiden menetelmien laajempi käyttö kuitenkin rajoittuu vielä muun muassa huonoihin tuotantosaantoihin sekä monet menetelmistä ovat liian kalliita tai monimutkaisia.

Description

Supervisor

Kontturi, Eero

Thesis advisor

Julin, Sofia

Keywords

DNA-nanoteknologia, DNA-origamitekniikka, yksijuosteinen DNA, runkojuoste, bakteriofagipohjainen, PCR-pohjainen

Other note

Citation