Machine vision methods for cell manipulation

Loading...
Thumbnail Image

URL

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Sähkötekniikan korkeakoulu | Master's thesis

Date

2016-10-31

Department

Major/Subject

Älykkäät tuotteet

Mcode

ETA3006

Degree programme

Automaatio- ja systeemitekniikka

Language

en

Pages

39+6

Series

Abstract

Machine vision methods can provide automatic solutions for cell manipulation. In this thesis implementations of machine vision algorithms were developed for recognizing and tracking objects in a video from a microscope setting. Those objects are a tip of the needle, cells and micro particles. For each object three different machine vision detection algorithms were tested within MATLAB©, the numerical computing environment. The performance of each implementation was evaluated and compared with each other. The results from the performed tests claim that the most suitable object detection method for the needle’s tip is the template matching and for the cells as well as the micro particles is the blob analysis.

Konenäön menetelmillä voidaan toteuttaa automaattisia ratkaisuita solumanipulointiin. Tässä diplomityössä kehitettiin konenäköalgoritmien toteutuksia, joilla tunnistetaan ja seurataan kohteita mikroskoopilla kuvatussa videokuvassa. Kohteet ovat pipetin kärki, solut ja mikropartikkelit. Jokaiselle kohteelle kehitettiin kolme toteutusta, jotka on kaikki tehty käyttämällä MATLAB©-ohjelman konenäkötyökalupakin funktioita ja ominaisuuksia. Jokaisen toteutuksen suoritusta arvioitiin ja vertailtiin muihin toteutuksiin. Testien perusteella parhaat menetelmät ovat ’template matching’ pipetin kärjelle ja ’blob analysis’ soluille ja mikropartikkeleille.

Description

Supervisor

Zhou, Quan

Thesis advisor

Cenev, Zoran

Keywords

object recognition, tracking, template matching, blob analysis, needle, cell

Other note

Citation