Differentiation between Candida africana and Candida albicans using proteomic mass spectrometry

Abstract

Fungal yeasts are common cause of infections in humans. One of the most widespread commensal yeast genus is Candida. Candida albicans is a pathogenic yeast that lives on human mucous membranes and causes infections ranging from mild to severe when the conditions are favorable. Candida africana is a relatively new species differentiated from Candida albicans. These two species have some phenotypic and morphological differences but since they are very closely related, discrimination is a challenge with molecular methods. Thermo Fisher Scientific has developed a workflow that identifies species using proteomic liquid chromatography - tandem mass spectrometry. In this study, we have found proteins that are species-specific and can be used to distinguish between C. africana and C. albicans. Hereby, this thesis describes the first reported method to differentiate between these species using mass spectrometry.

Sienihiivojen aiheuttamat infektiot ovat yleinen ihmisen sairastumisen syy. Yksi yleisimmistä ihmisen normaaliflooraan kuuluvista hiivasuvuista on Candida. Candida albicans on patogeeninen hiiva, joka elää ihmisen limakalvoilla ja aiheuttaa eriasteisia infektioita, kun olosuhteet ovat suotuisat. Candida africana on suhteellisen uusi laji, joka on erilaistunut Candida albicansista. Näillä kahdella lajilla on joitain fenotyyppisiä ja morfologisia eroja, mutta koska ne ovat hyvin läheisiä keskenään, niiden erottaminen molekulaarisilla metodeilla on haastavaa. Thermo Fisher Scientific on kehittänyt menetelmän, joka tunnistaa lajeja proteomisella nestekromatografia-massaspektrometrialla. Tässä tutkimuksessa löydettiin proteiineja, jotka ovat lajispesifejä ja pystyvät erottamaan C. albicansin ja C. africanan toisistaan. Tässä diplomityössä kuvataan ensimmäinen raportoitu menetelmä näiden lajien erottamisesta masssapektrometrialla.