Structure-Activity Relationships in Heparin Binding and Supramolecular Materials

Thumbnail Image

Files

isbn9789526088891.pdf (2.45 MB)

URL

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

School of Chemical Technology | Doctoral thesis (article-based) | Defence date: 2020-01-17
Unless otherwise stated, all rights belong to the author. You may download, display and print this publication for Your own personal use. Commercial use is prohibited.

Authors

Date

2019

Department

Biotuotteiden ja biotekniikan laitos
Department of Bioproducts and Biosystems

Major/Subject

Mcode

Degree programme

Language

en

Pages

78 + app. 106

Series

Aalto University publication series DOCTORAL DISSERTATIONS, 238/2019

Abstract

Multivalent non-covalent interactions between particles can be utilized to direct assembly of the individual components into larger organized structures. This self-assembly process has been widely exploited in the development of novel materials for medicine and nanotechnology. The supramolecular approach was also applied in this thesis to create heparin antidotes and sensors in addition to novel biohybrid materials and halogen bonding -based complexes.  In publication I, a library of cationic block copolymers was synthetized to study how the polymer structure affects the electrostatic heparin binding. In short, adjustment of the polymer block lengths altered the binding efficiency, size of the forming complexes and biocompatibility. In publication II, heparin was neutralized with cationic macrocyclic compounds. The compounds were additionally capable of host-guest binding, which enabled colorimetric heparin sensing. Tailoring of the macrocycle structure was shown to be highly important as only the multivalent binders were effective in heparin complexation, and heparin sensing was attained solely with cavity size suitable for the guest binding. Publication III presents a bio-based approach for heparin binding and sensing. Engineered proteins with multiple heparin-binding motifs displayed effective heparin complexation in physiological conditions. Additionally, a fluorescent probe was employed for heparin concentration monitoring. In publication IV, a thermoresponsive polymer with cationic binding motifs was synthetized and combined with apoferritin protein cages to obtain supramolecular complexes. By fine-tuning the assembly conditions, thermoresponsive cocrystals could be produced. Complexes of polymers and resorcinarenes were attained through halogen bonding in publication V. The study revealed that the binding affinity and the assembly morphology of the colloids could be varied by changing the polymer architecture. In conclusion, the studies show that the supramolecular approach involving multivalent weak interactions and tailored molecular design is a competent way to create effective heparin binders and sensors in addition to novel self-assemblies. The information attained from the results can be further used in creation of new materials from polymers, proteins and macrocycles.

Monivalenttiset heikot vuorovaikutukset partikkeleiden välillä mahdollistavat itsenäisten komponenttien järjestäytymisen tarkasti määritellyiksi suuremmiksi kokonaisuuksiksi. Tämä supramolekulaarisen kemian lähestymistapa on ollut perustana myös tässä väitöskirjassa esitetyissä tutkimuksissa, jotka tähtäävät hepariinille sopivien vasta-aineiden ja sensoreiden valmistamiseen, sekä biohybridimateriaalien ja halogeenisidoksille perustuvia kompleksien muodostamiseen.  Julkaisussa I syntetisoitiin useita kationisia lohkopolymeerejä hepariinin sitomiseen. Tutkimuksessa havaittiin, että lohkojen pituuksia muokkaamalla voitiin vaikuttaa sitomistehokkuuden lisäksi kompleksien kokoon ja bioyhteensopivuuteen. Julkaisussa II hepariini neutralisoitiin kationisilla makrosyklisillä yhdisteillä, joita käytettiin myös hepariinin konsentraation seuraamiseen. Molekyylirakenteella osoitettiin olevan suuri vaikutus yhdisteiden suorituskykyyn, sillä vain monivalenttiset yhdisteet olivat tehokkaita hepariinin sitomisessa ja hepariinikonsentraation monitorointiin vaadittiin optimaalinen kaviteettikoko. Julkaisussa III käytettiin biopohjaisia yhdisteitä hepariinin sitomiseen ja konsentraation määrittämiseen. Proteiinit, joihin muokattiin useampi hepariiniin sitoutuva funktionaalisuus, kompleksoituivat hepariinin kanssa myös fysiologista ympäristöä vastaavissa olosuhteissa. Lisäksi proteiineja hyödynnettiin yhdessä fluoresenssisensorin kanssa hepariinin konsentraation seuraamiseen. Julkaisussa IV syntetisoitiin polymeerejä, joihin oli yhdistetty sekä kationisia rakenteita että lämpöön reagoiva osa. Näiden polymeerien sitoutumista apoferritiini-proteiinihäkkien kanssa tutkittiin ja havaittiin, että muokkaamalla kompleksoitumisolosuhteita saatiin muodostettua lämpöherkkiä yhteishiloja. Halogeenisitoutumiseen perustuvia komplekseja valmistettiin julkaisussa V polymeereistä ja makrosykleistä. Muuttamalla polymeerien rakennetta voitiin muokata sitoutumisvalmiutta ja muodostuneiden kompleksien morfologiaa. Yhteenvetona nämä tutkimukset osoittavat, että supramolekulaarinen lähestymistapa, joka hyödyntää monivalenttisia sidoksia ja tarkkaan suunniteltuja yhdisteitä, sopii hepariinin sitomiseen ja sen konsentraation monitorointiin sekä uudenlaisten kiteiden ja kolloidien muodostamiseen.

Description

Supervising professor

Kostiainen, Mauri, Prof., Aalto University, Department of Bioproducts and Biosystems, Finland

Thesis advisor

Kostiainen, Mauri, Prof., Aalto University, Department of Bioproducts and Biosystems, Finland
Linko, Veikko, Dr., Aalto University, Department of Bioproducts and Biosystems, Finland

Keywords

supramolecular chemistry, self-assembly, polymer, heparin, macrocycle, supramolekulaarinen kemia, itsejärjestäytyminen, polymeerit, hepariini, makrosyklit

Other note

Parts

  • [Publication 1]: Salla Välimäki, Alexey Khakalo, Ari Ora, Leena-Sisko Johansson, Orlando J. Rojas, and Mauri A. Kostiainen, Effect of PEG–PDMAEMA Block Copolymer Architecture on Polyelectrolyte Complex Formation with Heparin, Biomacromolecules, 2016, 17, 2891,
    DOI: 10.1021/acs.biomac.6b00699 View at publisher
  • [Publication 2]: Salla Välimäki, Ngong Kodiah Beyeh, Veikko Linko, Robin H. A. Ras, and Mauri A. Kostiainen, A supramolecular host–guest complex for heparin binding and sensing, Nanoscale, 2018, 10, 14022,
    DOI: 10.1039/C8NR03132K View at publisher
  • [Publication 3]: Qing Liu, Salla Välimäki, Ahmed Shaukat, Boxuan Shen, Veikko Linko, and Mauri A. Kostiainen, Serum Albumin–Peptide Conjugates for Simultaneous Heparin Binding and Detection, ACS Omega, in press,
    DOI: 10.1021/acsomega.9b02883 View at publisher
  • [Publication 4]: Salla Välimäki, Joona Mikkilä, Ville Liljeström, Henna Rosilo, Ari Ora, and Mauri A. Kostiainen, Hierarchically Ordered Supramolecular Protein- Polymer Composites with Thermoresponsive Properties, International Journal of Molecular Sciences, 2015, 16, 10201,
    DOI: 10.3390/ijms160510201 View at publisher
  • [Publication 5]: Salla Välimäki, Lotta Gustavsson, Ngong Kodiah Beyeh, Veikko Linko, and Mauri A. Kostiainen, Halogen-Bond-Mediated Self-Assembly of Polymer–Resorcinarene Complexes, Macromolecular Rapid Communications, 2019, 40, 1900158,
    DOI: 10.1002/marc.201900158 View at publisher

Citation

Permanent link to this item

https://urn.fi/URN:ISBN:978-952-60-8889-1

Collections

[diss] Kemian tekniikan korkeakoulu / CHEM