Title: | On Computational Modeling of Biological Development Biologisen kehityksen laskennallisesta mallintamisesta |
Author(s): | Häkkinen, Teemu J. |
Date: | 2019 |
Language: | en |
Pages: | 45 + app. 95 |
Department: | Matematiikan ja systeemianalyysin laitos Department of Mathematics and Systems Analysis |
ISBN: | 978-952-60-8726-9 (electronic) 978-952-60-8725-2 (printed) |
Series: | Aalto University publication series DOCTORAL DISSERTATIONS, 170/2019 |
ISSN: | 1799-4942 (electronic) 1799-4934 (printed) 1799-4934 (ISSN-L) |
Supervising professor(s): | Hannukainen, Antti, Prof., Aalto University, Department of Mathematics and Systems Analysis, Finland |
Thesis advisor(s): | Jernvall, Jukka, Prof., University of Helsinki, Finland |
Subject: | Mathematics |
Keywords: | finite element method, level set method, Stokes equation, diffusion-limited growth, free boundary problems, tissue growth, computational modeling, morphogenesis, elementtimenetelmä, level set -menetelmä, Stokesin yhtälö, diffuusiorajoitteinen kasvu, vapaan reunan ongelma, kudoksen kasvu, laskennallinen mallintaminen, morfogeneesi |
Archive | yes |
|
|
Abstract:Tässä väitöskirjassa tarkastellaan biologisen kaavoituksen ja kasvun matemaattista mallinnusta. Perimmäisenä tavoitteena on rakentaa realistisia mutta tehokkaita matemaattisia malleja kuvaamaan sekä biologisten rakenteiden muodostumista että laajemmin evolutiivisia prosesseja, jotka muovaavat noita rakenteita. Kehitykselliset mekanismit sekä ohjaavat että rajoittavat biologisten rakenteiden evoluutiota, ja matemaattiset mallit tarjoavat tehokkaan työkalun noiden rajoitusten ymmärtämiseen. |
|
Parts:[Publication 1]: Harjunmaa E, Seidel K, Häkkinen T, Renvoisé E, Corfe IJ, Kallonen A, Zhang ZQ, Evans AR, Mikkola ML, Salazar-Ciudad I, Klein OD, Jernvall J. Replaying evolutionary transitions from the dental fossil record. Nature, 2014, 512, pp. 44–48. DOI: 10.1038/nature13613 View at Publisher [Publication 2]: Prochazkova M, Häkkinen TJ, Prochazka J, Spoutil F, Jheon AH, Ahn Y, Krumlauf R, Jernvall J, Klein OD. FGF signaling refines Wnt gradients to regulate patterning of taste papillae. Development, 2017, 144, pp. 2212-2221. DOI: 10.1242/dev.148080 View at Publisher [Publication 3]: Häkkinen TJ, Sova SS, Tjäderhane L, Hannukainen A, Jernvall J. Modeling enamel matrix secretion in mammalian teeth. PLoS Comput Biol, 2019, 15(5):e1007058, 12 pages. Full text in Acris/Aaltodoc: http://urn.fi/URN:NBN:fi:aalto-201907304502. DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007058 View at Publisher [Publication 4]: Häkkinen TJ, Hannukainen A, Jernvall, J. Modeling tissue growth with the Stokes equation. Submitted to a journal, 19 pages, May 2019. DOI: 10.1101/641282 View at Publisher |
|
|
Unless otherwise stated, all rights belong to the author. You may download, display and print this publication for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Page content by: Aalto University Learning Centre | Privacy policy of the service | About this site